Répétition anormale  de trinucléotidiques CAG , qui va coder pour une polyglutamine. Les chaines de polyglutamine trop longues vont s'accumuler et faire des lésions nucléaires porovoquant en particulier la dégénérescence des neurones du striatum (noyau caudé, putamen, nucleus acumbens). Les inclusions de polyglutamine  sont retrouvées  dans le noyau.

Troubles moteurs (accentuation des mouvements involontaires, ralentissement des mouvements volontaires), troubles cognitifs:  mémoire, langage, attention; trouble de l'humeur: dépression, colères.

 Approche thérapeutique possible par injection de tissu striatal foetal.