Le cortex préfrontal gauche est responsable de la sensation de sentiments positifs (joie, bonne humeur,..). Une chose agréable (jolie fille pour un jeune chercheur; crédits débloqués pour un vieux chercheur) se visualise par l'activation de cette région.

Le cortex préfrontal droit est associé aux sentiments négatifs ( tristesse,....)

Inversement, un processus pathologique dans le cortex préfrontal droit va provoquer une euphorie ou des rires incontrôlés.

Pour la partie gauche, ce sera une dépression

Correspond aux régions néocorticales antérieures (aires de Brodmann 9 et 10). Cette région parait vouée au choix du comportement approprié dans une situation donnée. Une lésion de cette région induit un comportement impudique, des réactions immédiates et violentes à la moindre stimulation, une grande instabilité émotionnelle, une perte des capacités de concentration, de motivation et d'ambition.
Les lobes préfrontaux jouent un rôle majeur dans l'élaboration de la pensée, ou idéation. Il retarde une réponse à un stimulus afin d'analyser l'information et de choisir le réponse la plus adéquate, il considère la conséquence d'un geste avant de l'effectuer, il met en corrélation toutes les données disponibles pour résoudre un problème complexe. Si les lobes préfrontaux ne sont pas le siège de la pensée la plus évoluée, ce sont eux qui la rendent possible.