Alzheimer APP sequence

A S SEQUENCE Beta Beta' alpha gamma cleavages

1	M	1
2	L	2
3	P	3
4	G	4
5	L	5
6	A	6
7	L	7
8	L	8
9	L	9
10	L	10
11	A	11
12	A	12
13	W	13
14	T	14
15	A	15
16	R	16
17	A	17
18	L	18
19	E	19	End Exon1
20	V	20
21	P	21			g
22	T	22
23	D	23
24	G	24
25	N	25
26	A	26
27	G	27
28	L	28
29	L	29
30	A	30
31	E	31
32	P	32
33	Q	33
34	I	34
35	A	35
36	M	36
37	F	37
38	C	38
39	G	39
40	R	40
41	L	41
42	N	42
43	M	43
44	H	44
45	M	45
46	N	46
47	V	47
48	Q	48
49	N	49
50	G	50
51	K	51
52	W	52
53	D	53
54	S	54
55	D	55
56	P	56
57	S	57
58	G	58
59	T	59
60	K	60
61	T	61
62	C	62
63	I	63
64	D	64
65	T	65
66	K	66
67	E	67
68	G	68			68-81: 22C11 mAb
69	I	69
70	L	70
71	Q	71
72	Y	72
73	C	73
74	Q	74
75	E	75	End exon2
76	V	76
77	Y	77
78	P	78
79	E	79
80	L	80
81	Q	81
82	I	82
83	T	83
84	N	84
85	V	85
86	V	86
87	E	87
88	A	88
89	N	89
90	Q	90
91	P	91
92	V	92
93	T	93
94	I	94
95	Q	95
96	N	96
97	W	97
98	C	98
99	K	99
100	R	100
101	G	101
102	R	102
103	K	103
104	Q	104
105	C	105
106	K	106
107	T	107
108	H	108
109	P	109
110	H	110
111	F	111
112	V	112
113	I	113
114	P	114
115	Y	115
116	R	116
117	C	117
118	L	118	End Exon 3
119	V	119
120	G	120
121	E	121
122	F	122
123	V	123
124	S	124
125	D	125
126	A	126
127	L	127
128	L	128
129	V	129
130	P	130
131	D	131
132	K	132
133	C	133
134	K	134
135	F	135
136	L	136
137	H	137
138	Q	138
139	E	139
140	R	140
141	M	141
142	D	142
143	V	143
144	C	144
145	E	145
146	T	146
147	H	147
148	L	148
149	H	149
150	W	150
151	H	151
152	T	152
153	V	153
154	A	154
155	K	155
156	E	156
157	T	157	end exon 4
158	C	158
159	S	159
160	E	160
161	K	161
162	S	162
163	T	163
164	N	164
165	L	165
166	H	166
167	D	167
168	Y	168
169	G	169
170	M	170
171	L	171
172	L	172
173	P	173
174	C	174
175	G	175
176	I	176
177	D	177
178	K	178
179	F	179
180	R	180
181	G	181
182	V	182
183	E	183
184	F	184
185	V	185
186	C	186
187	C	187
188	P	188
189	L	189
190	A	190
191	E	191
192	E	192
193	S	193
194	D	194
195	N	195
196	V	196
197	D	197
198	S	198
199	A	199
200	D	200
201	A	201
202	E	202
203	E	203
204	D	204
205	D	205
206	S	206
207	D	207
208	V	208
209	W	209
210	W	210
211	G	211
212	G	212
213	A	213
214	D	214
215	T	215
216	D	216
217	Y	217
218	A	218
219	D	219
220	G	220
221	S	221	end Exon 5
222	E	222
223	D	223
224	K	224
225	V	225
226	V	226
227	E	227
228	V	228
229	A	229
230	E	230
231	E	231
232	E	232
233	E	233
234	V	234
235	A	235
236	E	236
237	V	237
238	E	238
239	E	239
240	E	240
241	E	241
242	A	242
243	D	243
244	D	244
245	D	245
246	E	246
247	D	247
248	D	248
249	E	249
250	D	250
251	G	251
252	D	252
253	E	253
254	V	254
255	E	255
256	E	256
257	E	257
258	A	258
259	E	259
260	E	260
261	P	261
262	Y	262
263	E	263
264	E	264
265	A	265
266	T	266
267	E	267
268	R	268
269	T	269
270	T	270
271	S	271
272	I	272
273	A	273
274	T	274
275	T	275
276	T	276
277	T	277
278	T	278
279	T	279
280	T	280
281	E	281
282	S	282
283	V	283
284	E	284
285	E	285
286	V	286
287	V	287
288	R	288	end Exon 6
289	E	289
290	V
291	C
292	S
293	E
294	Q		Exon7
295	A		KUNITZ
296	E
297	T
298	G
299	P
300	C
301	R
302	A
303	M
304	I
305	S
306	R
307	W
308	Y
309	F
310	D
311	V
312	T
313	E
314	G
315	K
316	C
317	A
318	P
319	F
320	F
321	Y
322	G
323	G
324	C
325	G
326	G
327	N
328	R
329	N
330	N
331	F
332	D
333	T
334	E
335	E
336	Y
337	C
338	M
339	A
340	V
341	C
342	G
343	S
344	A
345	M
346	S
347	Q
348	S
349	L
350	L
351	K		Ox
352	T
353	T
354	Q
355	E
356	P
357	L
358	A
359	R
360	D
361	P
362	V
363	K
364	L
365	P
366	T
367	T
368	A
369	A
370	S
371	T
372	P
373	D
374	A
375	V
376	D
377	K
378	Y
379	L
380	E
381	T
382	P
383	G
384	D
385	E
386	N
387	E
388	H
389	A
390	H
391	F
392	Q
393	K
394	A
395	K
396	E
397	R
398	L
399	E
400	A
401	K
402	H
403	R
404	E
405	R
406	M
407	S
408	Q
409	V
410	M
411	R
412	E
413	W
414	E
415	E
416	A
417	E
418	R
419	Q
420	A
421	K
422	N
423	L
424	P
425	K
426	A
427	D
428	K
429	K
430	A
431	V
432	I
433	Q
434	H
435	F
436	Q
437	E
438	K
439	V
440	E
441	S
442	L
443	E
444	Q
445	E
446	A
447	A
448	N
449	E
450	R
451	Q
452	Q
453	L
454	V
455	E
456	T
457	H
458	M
459	A
460	R
461	V
462	E
463	A
464	M
465	L
466	N
467	D
468	R
469	R
470	R
471	L
472	A
473	L
474	E
475	N
476	Y
477	I
478	T
479	A
480	L
481	Q
482	A
483	V
484	P
485	P
486	R
487	P
488	R
489	H
490	V
491	F
492	N
493	M
494	L
495	K
496	K
497	Y
498	V
499	R
500	A
501	E
502	Q
503	K
504	D
505	R
506	Q
507	H
508	T
509	L
510	K
511	H
512	F
513	E
514	H
515	V
516	R
517	M
518	V
519	D
520	P
521	K
522	K
523	A
524	A
525	Q
526	I
527	R
528	S
529	Q
530	V
531	M
532	T
533	H
534	L
535	R
536	V
537	I
538	Y
539	E
540	R
541	M
542	N
543	Q
544	S
545	L
546	S
547	L
548	L
549	Y
550	N
551	V
552	P
553	A
554	V
555	A
556	E
557	E
558	I
559	Q
560	D
561	E
562	V
563	D
564	E
565	L
566	L
567	Q
568	K
569	E
570	Q
571	N
572	Y
573	S
574	D
575	D
576	V
577	L
578	A
579	N
580	M
581	I
582	S
583	E
584	P
585	R
586	I
587	S
588	Y
589	G
590	N
591	D
592	A
593	L
594	M
595	P
596	S
597	L
598	T
599	E
600	T
601	K
602	T
603	T
604	V
605	E
606	L
607	L
608	P
609	V
610	N
611	G
612	E
613	F
614	S
615	L
616	D
617	D
618	L
619	Q
620	P
621	W
622	H
623	S
624	F
625	G
626	A
627	D
628	S
629	V
630	P
631	A
632	N
633	T
634	E
635	N
636	E
637	V
638	E
639	P
640	V
641	D
642	A
643	R
644	P
645	A
646	A
647	D
648	R
649	G
650	L
651	T
652	T
653	R
654	P
655	G
656	S
657	G
658	L
659	T
660	N		End exon 16
661	I
662	K
663	T
664	E
665	E
666	I
667	S
668	E
669	V
670	K			N swedish
671	M		b (BACE)	L swedish

	D	1	CTF99	6E10--->
673	A	2
674	E	3
675	F	4		W02->
676	R	5
677	H	6
678	D	7
679	S	8
680	G	9
681	Y	10		->WO2
682	E	11	b'cleavage

683	V	12
684	H	13
685	H	14
686	Q	15
687	K	16	K/L alpha	cleavage	(Adam10,	plasmin

688	L	17	CTF88			----->6E10	4G8--->
689	V	18
690	F	19
691	F	20
692	A	21		G Flemish
693	E	22		Q Dutch	G Artic	K
694	D	23		N Iowa
695	V	24					--->4G8
696	G	25
697	S	26
698	N	27
699	K	28
700	G	29				Membrane
701	A	30
702	I	31
703	I	32
704	G	33
705	L	34
706	M	35
707	V	36
708	G	37
709	G	38
710	V	39
711	V	40
712	I	41
713	A	42	T	Austrian
714	T	43	I/A	Iran
715	V	44	M French	Belgian
716	I	45		V Florida
717	V	46	F/G/I	London
718	I	47
719	T	48
720	L	49	Epsilon	cleavage

721

AICD

722	M		49
723	L		48	P Australian		Membrane
724	K		47	N Belgium
725	K	650	46
726	K		45
727	Q		44
728	Y		43
729	T		42
730	S		41	phosphorylation	trafficking
731	I		40
732	H		39
733	H		38
734	G		37
735	V	660	36
736	V		35
737	E		34
738	V		33
739	D	664	32
740	A		31
741	A		30
742	V		29
743	T	668	phosphorylated		Antibody	APP-668P
744	P		27
745	E	670	26
746	E		25
747	R		24
748	H		23
749	L		22
750	S		21
751	K		20
752	M		19
753	Q		18
754	Q		17
755	N	680	16
756	G		15
757	Y		14
758	E		13
759	N		12	Interaction
760	P		11	APP/Go proteins
761	T		10	/calcium
762	Y		9
763	K		8
764	F		7
765	F	690	6
766	E		5
767	Q		4
768	M		3
769	Q		2
770	N	695	Carboxy terminal